Cantos do fim do século, 1878.
A filosofia no Brasil, 1878.
Interpretação filosófica dos fatos históricos, 1880.
A literatura brasileira e a crítica moderna. Ensaio de generalização, 1880.
Introdução à história da literatura brasileira, 1882.
O Naturalismo em literatura, 1882.
Últimos harpejos, 1883.
Estudos de literatura contemporânea, 1885.
Contos populares do Brasil, 1885.
Estudos sobre a poesia popular do Brasil, 1888.
Etnografia brasileira, 1888.
História da literatura brasileira, 2 vols., 1888 (2ª. ed. 1902; 3ª. ed. 1943, organização e prefácio de Nélson Romero, 5 vols.).
A filosofia e o ensino secundário, 1889.
A história do Brasil ensinada pela biografia de seus heróis, 1890.
Parlamentarismo e presidencialismo na República, cartas ao Conselheiro Rui Barbosa, 1893.
Ensaios de Filosofia do Direito, 1895.
Machado de Assis, 1897.
Novos estudos de literatura contemporânea, 1898.
Ensaios de sociologia e literatura, 1901.
Martins Pena, 1901.
Parnaso sergipano, 2 vols., 1904.
Evolução do lirismo brasileiro, 1905.
Evolução da literatura brasileira, 1905.
Compêndio de história da literatura brasileira, em colaboração com João Ribeiro, 1906.
Discurso de recepção de Euclides da Cunha na ABL, 1907.
Zeverissimações ineptas da crítica, 1909.
Da crítica e sua exata definição, 1909.
Provocações e debates, 1910.
Quadro sintético da evolução dos gêneros na literatura brasileira, 1911.
Minhas contradições, 1914.